PROCC

Paulo Ricardo Batista

Jovem Cientista Nosso Estado (FAPERJ, desde 2018) Pesquisador em Saúde Pública da FIOCRUZ - PROCC, na área de Modelagem Molecular e professor do quadro permanente do programa de pós-graduação em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz. Possui graduação em Ciências Biológicas - Modalidade Médica pela UFRJ (2003), mestrado em Ciências Biológicas - Biofísica pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho/UFRJ (2005), doutorado em Ciências Biológicas - Biofísica pelo IBCCF/UFRJ (2009) e doutorado em Análise de Genomas e Modelagem Molecular em cotutela pela Université Paris 7 Denis Diderot (França). Realizou um ano e meio de pós-doutoramento no INMETRO-RJ (2009-10), na École Normale Supérieure de Cachan (França - 2010-12) e no Institut Pasteur de Paris (França - 2012), na Unité de Bio-Informatique Structurale, sob a supervisão do Dr. Michael Nilges. É revisor de 9 journals internacionais renomados. Tem experiência na área de Biofísica, com ênfase em Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos e Biotecnológicos. Atuando principalmente nos seguintes temas: Dinâmica Molecular, Dinâmica Essencial, Análise de Modos Normais, Modos Consensus, análises de energia livre, bioinformática e predição de estrutura de complexos macro-moleculares à partir de dados experimentais de baixa resolução (cryo-EM, crosslink-MS). Com aplicações em sistemas biológicos como: a protease de subtipos do HIV-1, catepsina B, plasmepsinas e outras protéinas-alvos em malária, celulase, RNA poymerase, etc. No contexto Biotecnológico, atua no desenvolvimento de biocombustíveis e desenvolvimento de fármacos para doenças negligenciadas. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/8265750834533915 (26/09/2019)

Rótulo/Grupo: Pesquisador

Bolsa CNPq: Nível 2

Período de análise: 2012-HOJE

Endereço: Fundação Oswaldo Cruz, Presidência da Fiocruz, PROCC - Programa de Computação Científica. Grupo de Biofísica Computational e Modelagem Molecular, PROCC. Residência Oficial, Avenida Brasil, 4365 Manguinhos 21045900 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil Telefone: (21) 38361103 URL da Homepage: http://www.procc.fiocruz.br/Members/pbatista

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Biofísica

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (13)
1. PENA, CARLOS EDUARDO ; Costa, Mauricio Garcia Souza ; Batista, Paulo Ricardo. Glycosylation effects on the structure and dynamics of a full-length Cel7A cellulase. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS. v. -, p. ---, issn: 1570-9639, 2019.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
2. COSTA, MAURICIO G. S. ; SILVA, YAGO FERREIRA ; Batista, Paulo Ricardo. Computational engineering of cellulase Cel9A-68 functional motions through mutations in its linker region. PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS. v. 20, p. 7643-7652, issn: 1463-9076, 2018.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
3. FERBER, MATHIAS ; KOSINSKI, JAN ; ORI, ALESSANDRO ; RASHID, UMAR J ; MORENO-MORCILLO, MARÍA ; SIMON, BERND ; BOUVIER, GUILLAUME ; Batista, Paulo Ricardo ; MÜLLER, CHRISTOPH W ; BECK, MARTIN ; NILGES, MICHAEL. Corrigendum: Automated structure modeling of large protein assemblies using crosslinks as distance restraints. NATURE METHODS. v. 15, p. 226-226, issn: 1548-7091, 2018.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
4. SOBRINHO SANTOS, ELIANE MACEDO ; DA ROCHA, ROGÉRIO GONÇALVES ; Batista, Paulo Ricardo ; SOUSA SANTOS, SÉRGIO HENRIQUE ; DE PAULA, ALFREDO MAURÍCIO BATISTA ; SENA GUIMARÃES, ANDRÉ LUIZ ; FARIAS, LUCYANA CONCEIÇÃO. Gallic Acid Modulates Neoplastic Phenotype and Gene Expression in Oral Cancer Cells Through Regulation of Leptin Pathway. Oral Surgery Oral Medicine Oral Pathology Oral Radiology. v. 126, p. e183, issn: 2212-4403, 2018.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
5. SANTOS, E. M. S. ; SANTOS, H. O. ; GUIMARAES, T. A. ; FRAGA, C. A. C. ; ROCHA, R. G. ; SILVEIRA, L. H. ; BATISTA, P. R. ; OLIVEIRA, P. S. L. ; MELO, G. A. ; SANTOS, S. H. ; PAULA, A. M. B. ; GUIMARAES, A. L. S. ; FARIAS, L. C.. Gallic acid modulates phenotypic behavior and gene expression in oral squamous cell carcinoma cells by interfering with leptin pathway. PATHOLOGY RESEARCH AND PRACTICE. v. ., p. ., issn: 0344-0338, 2017.
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6. BRANDT, ARTUR M. L. ; Batista, Paulo Ricardo ; SOUZA-SILVA, FRANKLIN ; ALVES, CARLOS ROBERTO ; CAFFARENA, ERNESTO RAUL. Exploring the unbinding of Leishmania (L.) amazonensis CPB derived-epitopes from H2 MHC class I proteins. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS. v. 84, p. n/a-n/a, issn: 0887-3585, 2016.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
7. FERBER, MATHIAS ; KOSINSKI, JAN ; ORI, ALESSANDRO ; RASHID, UMAR J ; MORENO-MORCILLO, MARÍA ; SIMON, BERND ; BOUVIER, GUILLAUME ; Batista, Paulo Ricardo ; MÜLLER, CHRISTOPH W ; BECK, MARTIN ; NILGES, MICHAEL. Automated structure modeling of large protein assemblies using crosslinks as distance restraints. NATURE METHODS. v. ., p. .-., issn: 1548-7091, 2016.
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8. COSTA, MAURICIO GARCIA DE SOUZA; Batista, Paulo Ricardo ; Bisch, Paulo Mascarello ; PERAHIA, DAVID. Exploring free energy landscapes of large conformational changes: Molecular Dynamics with Excited Normal modes. Journal of Chemical Theory and Computation. v. 11, p. 150420160913007-2767, issn: 1549-9618, 2015.
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9. FLOQUET, NICOLAS ; COSTA, MAURICIOG.S. ; BATISTA, PAULOR. ; RENAULT, PEDRO ; BISCH, PAULOM. ; RAUSSIN, FLORENT ; MARTINEZ, JEAN ; MORRIS, MAYC. ; Perahia, David. Conformational Equilibrium of CDK/Cyclin Complexes by Molecular Dynamics with Excited Normal Modes. Biophysical Journal (Print). v. 109, p. 1179-1189, issn: 0006-3495, 2015.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
10. BORGES, P. V. ; MORET, K. H. ; MAYA-MONTEIRO, C. M. ; SOUZA-SILVA, F. ; ALVES, C. R. ; Batista, P. R. ; CAFFARENA, E. R. ; PACHECO, P. ; HENRIQUES, M. D. G. ; PENIDO, C.. Gedunin Binds to MD-2 and Impairs LPS-Induced TLR4 Signaling in Macrophages. Molecular Pharmacology. v. 88, p. 949-961, issn: 1521-0111, 2015.
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11. Costa, M. G. S. ; BENNETTI-BARBOSA, T. G. ; DESDOUITS, N. ; BLONDEL, A. ; BISCH, PAULO M ; PASCUTTI, P. G. ; BATISTA, P. R.. Impact of M36I polymorphism on the interaction of HIV-1 protease with its substrates: insights from molecular dynamics. BMC Genomics. v. 15, p. S5, issn: 1471-2164, 2014.
  [ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
12. NILGES, MICHAEL ; BOUVIER, GUILLAUME ; Batista, Paulo R. ; SPILL, YANNICK. Structures of Biomolecular Complexes from Heterogeneous Data and Bayesian Data Analysis. Biophysical Journal (Print). v. 104, p. 376a, issn: 0006-3495, 2013.
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13. da Rocha Pita, Samuel Silva ; Batista, Paulo Ricardo ; Albuquerque, Magaly Girão ; Pascutti, Pedro Geraldo. Molecular Dynamics Simulations of Peptide Inhibitors Complexed With Trypanosoma cruzi Trypanothione Reductase. Chemical Biology & Drug Design (Print). v. 80, p. 561-571, issn: 1747-0277, 2012.
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Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (0)
Textos em jornais de notícias/revistas (1)
1. Aguiar, D ; Amorim, G ; AGUIAR, J. M. C. ; Lery, LMS ; CUNHA, M. M. L. ; BATISTA, PAULOR.. Interview with the organizers of the second French-Brazilian Symposium on Biosciences. EURAXESS Links Brazil Newsletter, p. 7-8, 01 abr. 2014.
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Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (0)
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (7)
1. BATISTA, P. R. Structure modeling of large protein complexes using MS/crosslinking data as distance restraints. 2017. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. BATISTA, P. R. Análise dos modos normais para o estudo de mudanças conformacionais em proteínas. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
3. BATISTA, P. R. Structure modeling of large protein complexes using MS/crosslinking data as distance restraints. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. BATISTA, P. R. APPLICATIONS OF NORMAL MODE-BASED HYBRID APPROACHES TO EXPLORE PROTEIN ENERGY SURFACE. 2016. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
5. BATISTA, PAULO R. Predição de mudanças conformacionais em proteínas com técnicas híbridas de modelagem molecular. 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
6. BATISTA, P. R. Novas abordagens no Estudo de Estrutura e Função de Proteínas. 2013. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
7. Ricardo Batista, Paulo. Evaluating and validating the interaction of MHC proteins with predicted epitopes from Leishmania amazonensis C-terminal CPB: insights from metadynamics. 2013. Apresentação de Trabalho/Congresso
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro de patente (0)
Programas de computador sem registro de patente (0)
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (0)

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (0)
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (1)
1. Yago Ferreira e Silva. Manipulando a dinâmica da celulase Cel9A-68 através de mutações na região do linker. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas: Biofísica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Centro de Integração Empresa-Escola. Início: 2016.
  Orientador: Paulo Ricardo Batista.
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (1)
1. Amanda Souza Câmara. . Fundação Oswaldo Cruz, . 2017.
  Supervisor: Paulo Ricardo Batista.
Tese de doutorado (3)

Carlos Eduardo Pena Junior. Efeito das glicosilações sobre a estrutura e dinâmica da celulase Cel7A de Trichoderma reesei. Tese (Doutorado em Programa de Biologia Computacional e Sistemas) - Instituto Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2019.
Orientador: Paulo Ricardo Batista.
Lucas de Almeida Machado. Modelagem molecular de componentes do T6SS. Tese (Doutorado em Programa de Biologia Computacional e Sistemas) - Instituto Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Paulo Ricardo Batista.
Thiago da Silva Frasson. Estudo conformacional da protease do HIV resistente a múltiplas drogas. Tese (Doutorado em Programa de Biologia Computacional e Sistemas) - Instituto Oswaldo Cruz, . 2015.
Supervisor: Paulo Ricardo Batista.
Dissertação de mestrado (3)

Christian Sagave Mazzocco de Almeida. Caracterização do mecanismo de ação do Sistema de Secreção do tipo VI: dinâmica molecular dos componentes estruturais. Dissertação (Mestrado em Programa de Biologia Computacional e Sistemas) - Instituto Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Orientador: Paulo Ricardo Batista.
Aline Beatriz Mello Rodrigues. Desenvolvimento de um servidor para predição de dados de troca hidrogênio/deutério em proteínas. Dissertação (Mestrado em Programa de Biologia Computacional e Sistemas) - Instituto Oswaldo Cruz, . 2016.
Orientador: Paulo Ricardo Batista.
Lucas de Almeida Machado. Análise da flexibilidade de proteínas através da análise de modos normais. Dissertação (Mestrado em Programa de Biologia Computacional e Sistemas) - Instituto Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2014.
Orientador: Paulo Ricardo Batista.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (1)

Victória Alves Barel. Descoberta de potenciais inibidores e novos sítios de ligação nodomínio RdRp da proteína NS5 do ZIKV através do uso deferramentas computacionais. (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2019.
Orientador: Paulo Ricardo Batista.
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (1)

Lucas de Almeida Machado. Análise da flexibilidade de proteínas por modos normais. Orientação de outra natureza - Fundação Oswaldo Cruz, . 2013.
Orientador: Paulo Ricardo Batista.

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (9)

2018-Atual. Inova Fiocruz - Geracao de Conhecimento
Descrição: Número de inscrição: 7461986481. Título do Projeto: Uma nova abordagem integrativa para a determinação da estrutura de proteínas-alvo visando o desenvolvimento de novos fármacos contra infecções multirresistentes. Coordenador: Paulo Ricardo Batista; Coordenadora adjunta: Leticia Miranda Lery Santos; valor aprovado: R$: 100.000,00. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Coordenador / Leticia Lery - Integrante.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
2018-Atual. Jovem Cientista Nosso Estado - FAPERJ
Descrição: E_04/2018. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Coordenador.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
2016-Atual. Pesquisa de novos efetores alostericos para proteinas envolvidas na sinalizacao celular: do uso de simulacoes computacionais a proposta de potenciais farmacos moduladores.
Descrição: CAPES/COFECUB Edital #16/2016 Coordenador Francês: Dr. Nicolas Floquet. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Integrante / PAULO MASCARELLO BISCH - Coordenador / Ernesto R. Caffarena - Integrante / David Perahia - Integrante / Maurício Garcia Souza Costa - Integrante / Pedro Geraldo Pascutti - Integrante / Nicolas Floquet - Integrante.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Descrição: CAPES/COFECUB Edital #16/2016 Coordenador França: Dr. Nicolas Floquet. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ernesto Raúl Caffarena - Integrante / Paulo M. Bisch - Coordenador / Pedro Pascutti - Integrante / Maurício Garcia de Souza Costa - Integrante / Nicolas Floquet - Integrante / Paulo Ricardo Batista - Integrante / David Perahia - Integrante.
Membro: Ernesto Raul Caffarena.
2016-Atual. Uma nova abordagem integrativa para o estudo da estrutura de grandes complexos macromoleculares: caracterizacao de alvos moleculares em doencas infecciosas e cronicas
Descrição: Programa Apoio a Grupos Emergentes de Pesquisa no Estado do Rio de Janeiro. FAPERJ-RJ.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Coordenador / Maurício Garcia Souza Costa - Integrante / Leticia Lery - Integrante / Gisele Cardoso Amorim - Integrante / Viviane Silva de Paula - Integrante. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
2014-Atual. Reengenharia de Celulases por metodos computacionais para a melhoria da producao de biocombustiveis de segunda geracao
Descrição: Apoio a Projetos de Pesquisa / MCTI/CNPQ/Universal 14/2014 - Faixa A - até R$ 30.000,00 462004/2014-7. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Coordenador / Pedro Geraldo Pascutti - Integrante / Ernesto R. Caffarena - Integrante / Maurício Garcia Souza Costa - Integrante / Tácio Vinício Amorim Fernandes - Integrante / Wanderley de Souza - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Descrição: Apoio a Projetos de Pesquisa / MCTI/CNPQ/Universal 14/2014 - Faixa A. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ernesto Raúl Caffarena - Integrante / Pedro Pascutti - Integrante / Wanderley de Souza - Integrante / Fernandes, Tácio Vinício Amorim - Integrante / Maurício Garcia de Souza Costa - Integrante / Paulo Ricardo Batista - Coordenador.
Membro: Ernesto Raul Caffarena.
2014-Atual. Criando enzimas mais eficientes para a producao de biocombustiveis usando ferramentas computacionais
Descrição: APQ1 - Auxílio à pesquisa básica n# E-26/110.568/2014. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Coordenador / Ernesto R. Caffarena - Integrante / Maurício Garcia Souza Costa - Integrante / Pascutti, Pedro G - Integrante / Wanderley de Souza - Integrante. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Descrição: Descrição: APQ1 - Auxílio à pesquisa básica n# E-26/110.568/2014 .. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . Integrantes: Mauricio Garcia de Souza Costa - Integrante / Pascutti, Pedro G. - Integrante / Batista, Paulo R - Coordenador / de Souza, Wanderley - Integrante / Ernesto Raul Caffarena - Integrante. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
Membro: Mauricio Garcia de Souza Costa.
Descrição: E-26/110.568/2014. FAPERJ. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Ernesto Raúl Caffarena - Integrante / Wanderley de Souza - Integrante / Batista, Paulo R. - Coordenador / Pascutti, Pedro G - Integrante / Maurício Garcia de Souza Costa - Integrante.
Membro: Ernesto Raul Caffarena.
2013-Atual. Identificacao e caracterizacao de fatores de virulencia de Klebsiella pneumoniae atraves de metodos de biologia molecular, biologia estrutural, biologia celular e bioinformatica
Descrição: Projeto N° E-26/112.693/2012 Edital FAPERJ N° 29/2012 - Programa Apoio à Formação e Consolidação de Grupos de Pesquisa Multi-Institucionais e Interdisciplinares ? 2012 Instituições participantes: UFRJ, UERJ, FIOCRUZ. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Integrante / PAULO MASCARELLO BISCH - Coordenador / Leticia Lery - Integrante / Marcel Menezes Lyra da Cunha - Integrante / Fabio Ceneviva Lacerda Almeida - Integrante / Gisele Cardoso Amorim - Integrante / Juliana de Mattos Coelho Aguiar - Integrante. Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
2013-Atual. Estudo de compostos com potencial farmacologico e vacinal no controle do ciclo de transmissao da Leishmania sp.: Uma abordagem computacional
Descrição: Auxílio à Pesquisa ? APQ1 - FAPERJ. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Integrante / Ernesto R. Caffarena - Coordenador / Carlos Roberto Alves - Integrante.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) . Integrantes: Ernesto Raúl Caffarena - Coordenador / BATISTA, Paulo Ricardo - Integrante / Franklin Souza da Silva - Integrante / Carlos Roberto Alves - Integrante / Maurício Garcia de Souza Costa - Integrante / artur brandt - Integrante.
Membro: Ernesto Raul Caffarena.
2012-Atual. Metodos de Modelagem Molecular Aplicados no Estudo Estrutural de Cadeias de Celulose e seus Complexos com Celulases para Producao de Biocombustiveis.
Descrição: submetido para Chamada MCTI/CNPq/Inmetro Nº 08/2012. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Paulo Ricardo Batista - Integrante / Pedro Geraldo Pascutti - Integrante / Diego Enry Barreto Gomes - Coordenador.
Membro: Paulo Ricardo Batista.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (7)

Jovem Cientista Nosso Estado, FAPERJ.. 2018.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Bolsa de Produtividade em Pesquisa - PQ, CNPq.. 2018.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Menção honrosa ao trabalho "Modeling MS native-state amide hydrogen exchange through structural and dynamical properties", VIII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos., LNCC.. 2016.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
5th Most Read Article (May-June 2015) - Journal of Chemical Theory and Computation (Costa et al, DOI: 10.1021/acs.jctc.5b00003), ACS Publications., J. Chem. Theory Comput... 2015.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Prêmio "Universidad de La Habana", Universidad de La Habana.. 2014.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Premio Nacional de La Academia De Ciencias de Cuba, La Academia de Ciencias de Cuba.. 2014.
Membro: Paulo Ricardo Batista.
Melhor poster no X-Meeting BSB 2013, AB3C e BSB.. 2013.
Membro: Paulo Ricardo Batista.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (10)

IV Escola Brasileira de Modelagem Molecular.Structure modeling of large protein complexes using MS/crosslinking data as distance restraints. 2017. (Outra).
3rd Annual Workshop of the SAIMS (South American Innitiative in Molecular Simulations) and the Center for Computational Engineering Sciences at Unicamp (CCES.-. 2016. (Outra).
IV Workshop em Métodos Computacionais Aplicados às Ciências Farmacêuticas. Análise dos modos normais para o estudo de mudanças conformacionais em proteínas. 2016. (Congresso).
1st Symposium on Current Topics in Molecular Biophysics.Close correspondence between flexibility profiles derived from normal mode analysis and exp erimental data from hydrogen/deuterium exchange rates for a set of different proteins. 2014. (Simpósio).
2nd French-Brazilian Symposium on Biosciences.Opening Cerimony as president of the Br.Bio.fr. 2014. (Simpósio).
ISCB-LA/X-MEETING in Bioinformatics/BSB/SoiBio. A Statistical Model for prediction of hydrogen/deuterium exchange based on data from Normal Mode Analysis.. 2014. (Congresso).
Mini-simpósio Especial da Reunião Anual do Projeto Casadinho/PROCAD Programa de Pós-Graduação em Bioinformática ICB/UFMG e Programa de Biologia Computacional e Sistemas d.A Statistical Model for prediction of hydrogen/deuterium exchange based on data from Normal Mode Analysis.. 2014. (Simpósio).
3o Simpósio de integração PG-BCS/FIOCRUZ-RJ e PG-Bi3o Simpósio de integração PG-BCS/FIOCRUZ-RJ e PG-Bioinfo/UFMGoinfo/UFMG. 2013. (Simpósio).
WORKSHOP DEFIS - Biophysics of large macromolecular assemblies : experiments and simulations. Evaluating and validating the interaction of MHC proteins with predicted epitopes from Leishmania amazonensis C-terminal CPB: insights from metadynamics. 2013. (Congresso).
X-Meeting BSB 2013 - International Conference of the AB3C and the Brazilian Symposium on Bioinformatics. Using metadynamics to evaluate the binding affinity between H-2 MHC class I proteins and peptides derived from the C-terminal of CPB of Leishmania amazonensis. 2013. (Congresso).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (8)

BATISTA, PAULOR.; Lery, LMS ; AMORIM, G. C. ; CUNHA, M. M. L.. 4th French Brazilian Symposium on Biosciences. 2018. Congresso
Dardenne, Laurent E. ; Caffarena, Ernesto R. ; Pascutti, Pedro G ; BATISTA, P. R. ; GOLIATT, P. V. Z. C. ; GUEDES, I. A. ; MAGALHAES, C. S. ; Gomes, Diego E. B. ; CUSTODIO, F. L.. IX ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. 2018. Congresso
BATISTA, P. R.; Lery, LMS ; IZADI-PRUNEYRE, N. ; ALMEIDA, M. S. ; BISCH, P. M. ; AMORIM, G. C. ; CUNHA, M. M. L. ; FREITAS, M. S.. Rio International School in Structural Biology. 2018. Congresso
DARDENNE, L.E. ; CAFFARENA, E. R. ; PASCUTTI, P. G. ; COSTA, M. G. S. ; BATISTA, P. R. ; GOLIATT, P. V. Z. C. ; MAGALHAES, C. S. ; GOMES, D. E. B. ; CUSTODIO, F. L. ; GUEDES, I. A.. VIII ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. 2016. Congresso
BATISTA, P. R.; Lery, LMS ; AMORIM, G. C. ; CUNHA, M. M. L.. 3rd French Brazilian Symposium on Biosciences - III Br.bio.Fr. 2016. Congresso
BATISTA, P. R.; Lery, LMS ; AMORIM, G. C. ; CUNHA, M. M. L. ; AGUIAR, J. M. C. ; Aguiar, D. 2nd French-Brazillian Symposium on Biosciences. 2014. Congresso
DARDENNE, L.E. ; CAFFARENA, E. R. ; PASCUTTI, P. G. ; COSTA, M. G. S. ; BATISTA, P. R. ; GOLIATT, P. V. Z. C. ; CUSTODIO, F. L. ; GOMES, D. E. B. ; MAGALHAES, C. S.. VII ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS. 2014. Congresso
BATISTA, P. R.; Lery, LMS ; Aguiar, D ; Amorim, G ; Cunha, M ; Coelho, J. 1st French-Brazilian Symposium on Biosciences. 2012. Congresso

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (2)

Paulo Ricardo Batista ⇔ Mauricio Garcia de Souza Costa (5.0)
PENA, CARLOS EDUARDO ; Costa, Mauricio Garcia Souza ; Batista, Paulo Ricardo. Glycosylation effects on the structure and dynamics of a full-length Cel7A cellulase. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS. v. -, p. ---, issn: 1570-9639, 2019.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
COSTA, MAURICIO G. S. ; SILVA, YAGO FERREIRA ; Batista, Paulo Ricardo. Computational engineering of cellulase Cel9A-68 functional motions through mutations in its linker region. PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS. v. 20, p. 7643-7652, issn: 1463-9076, 2018.
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FLOQUET, NICOLAS ; COSTA, MAURICIOG.S. ; BATISTA, PAULOR. ; RENAULT, PEDRO ; BISCH, PAULOM. ; RAUSSIN, FLORENT ; MARTINEZ, JEAN ; MORRIS, MAYC. ; Perahia, David. Conformational Equilibrium of CDK/Cyclin Complexes by Molecular Dynamics with Excited Normal Modes. Biophysical Journal (Print). v. 109, p. 1179-1189, issn: 0006-3495, 2015.
[ citações Google Scholar | citações Microsoft Acadêmico | busca Google ]
COSTA, MAURICIO GARCIA DE SOUZA; Batista, Paulo Ricardo ; Bisch, Paulo Mascarello ; PERAHIA, DAVID. Exploring free energy landscapes of large conformational changes: Molecular Dynamics with Excited Normal modes. Journal of Chemical Theory and Computation. v. 11, p. 150420160913007-2767, issn: 1549-9618, 2015.
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Paulo Ricardo Batista ⇔ Ernesto Raúl Caffarena (2.0)
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Data de processamento: 19/11/2019 14:47:18

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